1968年2月17日出生，新疆維吾爾自治區伊寧縣人，原北京師範大學教育系學生。1989年學運期間曾擔任北師大常駐北高聯常委、北高聯次任主席（首任為周勇軍）；絕食發起人，參加與李鵬對話。

六四後，在當局全國通緝21名學生領袖名單上名列第2位。吾爾開希先流亡法國，後轉往美國三藩市楊百翰大學讀國際政治系，曾擔任「民主中國陣線」副主席。1994年與台灣女友赴台結婚，1996年定居台灣，1999年入籍中華民國。2008年在台灣開設科技公司。由於吾爾開希一直被禁回國，父母也被限制出境，因此吾爾開希前後三次試圖通過自首的方式回國與父母團聚，但皆被拒絕。

2019年六四30周年，吾爾開希認為，「記憶是我們對抗暴政的一個很謙卑的方式，我們也一直在對抗共產黨試圖抹殺我們的記憶，我們一直希望維持住這個記憶，用這種謙卑的方式進行反抗。」另，總結「八九六四」責任所在，「1989年這場運動真正的責任者，真正該承擔責任的就是中國政府，還沒有被追究責任的時候不應該去討論學生的責任。」現居台灣，任無國界記者組織榮譽董事。